A partire dall'etą di soli 6 anni partecipa alla guerra civile liberiana negli anni '80, nella cosiddetta "unitą dei ragazzini", facendosi conoscere come "diavolo bianco" e "Jack lo squartatore" fino a quando non viene recuperato da una ONG che raccoglie bambini-soldato, ottenendo una sistemazione migliore in America.
Raiden fa la sua prima apparizione nel secondo episodio della saga, Sons Of Liberty. In questo episodio il giovane Jack, appartenente al gruppo di forze speciali FOXHOUND, viene inviato sulla Big Shell (impianto di stoccaggio e raffinazione del petrolio a largo di New York) prima con il nome in codice di Snake, che verrą successivamente sostituito con Raiden. L'obiettivo di Raiden č salvare il presidente degli Stati Uniti che č sotto cattura dei Dead Cell ed eliminare i Dead Cell e il Metal Gear RAY. Sulla Big Shell, Raiden incontra il padre adottivo, Solidus Snake, clone anch'esso come il protagonista Solid Snake di Big Boss (Metal Gear Solid 3: Snake Eater), e il gią citato Solid Snake con il fidato compagno e scienziato Hal "Otacon" Hemmerich.
Scoprirą poi che Solidus aveva ucciso i suoi genitori e che il suo nome in codice, Raiden, deriva dall'omonimo caccia giapponese della 2a guerra mondiale, dato il suo vero nome.
Dopo l'incidente della Big Shell, Raiden decide di cercare Sunny, figlia di Olga Gurlocovich, che č stata rapita dai Patriots. Raiden riesce a trovarla ma viene catturato e rinchiuso nell'Area 51 dove č sottoposto a esperimenti del potenziamento del corpo (esoscheletro). Fortunatamente, l'Esercito del Paradiso Perduto guidato da EVA (nome in codice Big Mama), ex compagna di Big Boss, riesce a liberare Raiden il quale consegna la piccola Sunny nelle mani di Solid Snake.
Raiden fa la sua ricomparsa in Metal Gear Solid 4: Guns Of The Patriots sotto l'aspetto di un cyborg ninja. In MGS 4 si sfida per due volte conto il vecchio nemico Vamp, apparentemente immortale, che comunque eliminerą per sempre a Shadow Moses. In quest'ultima location Raiden salva Solid Snake dalla morte certa, ma perde entrambe le braccia. Nel finale lo vediamo coprire le spalle all'eroe Snake, brandendo la sua spada con la bocca e sgominando un gruppo di FROGS(gruppo privato d'elite di Liquid Ocelot)
Alla fine, Raiden incontra sua moglie Rose che gli presenta loro figlio, il piccolo John. Esso era stato tenuto all' oscuro di Raiden per potergli far concludere senza preoccupazione la sua missione, Nel finale la famiglia si riunisce nell'ospedale in cui Raiden č stato operato al braccio (di nuovo funzionante) e dove gli č stato rimosso l'esoscheletro.
